Salimos de Cusco (3,400 m) temprano por la mañana rumbo al bosque nublado, donde los Andes descienden hacia la cuenca amazónica. En el camino visitamos un humedal altoandino con aves acuáticas migratorias y locales, y cruzamos dos cordilleras entre los valles de Cusco y Paucartambo, hasta una altitud máxima de 3,900 m. Paramos en pueblos andinos y en las torres funerarias preincas (chullpas) de Ninamarca. En el abra Ajanaco, la entrada al Parque Nacional del Manu, los Andes comienzan su descenso hacia la Amazonía; con buen tiempo, la vista sobre el bosque nublado hasta la selva baja es impresionante. Después del almuerzo descendemos por el bosque enano hacia un mundo mágico de helechos gigantes, orquídeas, bromelias y begonias. Con paradas frecuentes, quizá veamos quetzales, trogones o pavas de monte antes de llegar por la tarde al Cock-of-the-Rock Lodge.

Muy temprano buscamos aves cerca del lodge y quizá monos choro o machines. Después del desayuno seguimos por carretera mientras las montañas dan paso a colinas y campos de cultivo, y visitamos en Patria una plantación de coca cultivada legalmente para el mercado peruano. Al mediodía llegamos al pequeño puerto de Atalaya, donde empieza la parte selvática del viaje: desde aquí viajamos en grandes canoas motorizadas con techo. En el Alto Madre de Dios vemos gaviotines, cormoranes, golondrinas de ala blanca y bandadas de chotacabras. Luego subimos hacia el norte por las aguas color chocolate del río Manu, entramos al parque, nos registramos en el puesto de control Limonal y seguimos hasta el Romero Lodge, donde los sonidos de la selva nos acompañan en la noche.

Por la mañana continuamos río Manu arriba. Gansos del Orinoco y gritadores unicornio pasean por las playas, las garzas patrullan la orilla y las tortugas se lanzan al agua desde sus troncos a nuestro paso. Después de unas cuatro horas llegamos a la Casa Matsiguenka, un lodge sencillo y cómodo administrado por las comunidades matsiguengas de Tayakome y Yomibato. Si hay tiempo, hacemos una caminata corta antes de la cena: nuestro primer encuentro con la selva virgen.

Hoy visitamos dos cochas, lagos formados cuando el río cambió de curso. Las autoridades del parque fijan la hora de nuestra visita a Cocha Salvador; según ella, visitamos Cocha Otorongo más temprano o más tarde. En el camino quizá veamos ronsocos en la orilla o, con mucha suerte, un jaguar. En Cocha Otorongo, un embarcadero y una torre de observación de 15 m permiten observar las orillas en busca de monos, martines pescadores, shanshos, aves serpiente y la familia de nutrias gigantes que vive allí. Cocha Salvador, la más grande de la zona con 3.5 km, la recorremos en un catamarán flotante: monos en los árboles, guacamayos en el cielo, garzas en la orilla, caimanes en el agua poco profunda y, con suerte, las tímidas nutrias gigantes pescando y jugando.

Partimos río abajo al amanecer, cuando las posibilidades de ver fauna son mejores, y salimos del parque por el puesto de control Limonal. Pasando el pueblo de Boca Manu, seguimos noventa minutos más río abajo hasta el Manu Wildlife Center, donde llegamos a tiempo para el almuerzo. Por la tarde, nuestro guía nos lleva por los senderos del lodge en busca de monos y muchas especies de aves; quien tenga energía puede subir a la torre de observación sobre el dosel. Por la noche, si el nivel del río lo permite, salimos en bote a buscar caimanes y otros animales nocturnos.

Tras una salida temprana y un corto viaje en bote, un sendero de 20 minutos nos lleva a la collpa de guacamayos de Blanquillo. Desde un cómodo escondite desayunamos mientras guacamayos rojo y verde y loros de cabeza azul, harinosos, de corona amarilla y de mejilla naranja se reúnen en las copas de los árboles y finalmente bajan en un espectáculo colorido y ruidoso a comer arcilla. La collpa está más activa de agosto a octubre y menos en mayo y junio. Después del almuerzo recorremos los senderos y luego caminamos hasta la famosa collpa de tapires, la más activa conocida en la Amazonía. Desde una plataforma elevada y acolchada con colchones y mosquiteros esperamos, a veces durante horas, a que los tapires, los animales terrestres más grandes de Sudamérica, salgan del bosque a comer arcilla a solo 10–20 m. Se permite fotografiar con flash.

Salimos muy temprano del lodge para un viaje en bote de unas dos horas y media río abajo hasta el pueblo minero de Colorado; el desayuno se sirve en el lodge o en el bote. En el camino vemos asentamientos ribereños y mineros de oro a orillas del Madre de Dios. Desde Colorado viajamos unos 45 minutos hasta Puerto Carlos, cruzamos el río Inambari en bote hasta Santa Rosa y seguimos en van unas dos horas y media hasta el aeropuerto de Puerto Maldonado, desde donde vuelas a Cusco o Lima.